南京农业大学揭示开放染色质互作在小麦多倍化中的调控作用

　　1月24日，《基因组生物学》期刊在线发表南京农业大学宋庆鑫团队的相关研究成果。基因组多倍化可以帮助物种具备更广泛的环境适应能力，是物种形成和进化的重要驱动力，在自然界中广泛存在。普通小麦(AABBDD)由二倍体祖先种经历两轮的杂交和基因组加倍形成的异源六倍体作物。在小麦发育和环境应答过程中，功能元件和基因之间的广泛互作对于基因表达具有重要的调控作用。小麦庞大(16 Gb)而复杂的基因组导致其精确的染色质互作图谱难以绘制，严重制约了小麦三维基因组的研究。该研究利用OCEAN-C技术绘制了不同倍性小麦的开放染色质互作图谱，并整合了染色质可及性、组蛋白修饰和转录组，发现小麦多倍化和进化过程中染色质结构变异引起开放染色质空间拓扑结构改变，并揭示了开放染色质三维互作变化对基因表达的调控作用，为多倍体作物进化和驯化中表观遗传调控机制解析提供了新思路。